我国流行的4株狂犬病街毒株G基因序列及分子流行病学研究G Gene Sequence and Molecular Epidemiology of 4 Street Virus Strains of Rabie Virus Isolated in China
刘胜牙,严家新,徐葛林,吴杰,郑新雄
摘要(Abstract):
目的探讨我国流行的狂犬病毒(RV)基因差异,评价现有疫苗的适用性。方法通过RT-PCR并对其产物测序后获得4株RV街毒株的G基因序列以及G与M和L基因的区间序列。利用计算机分析软件比较4株RV与已经发表的毒株的核苷酸和推导的氨基酸序列。结果糖蛋白(GP)完整的编码基因序列长度为1575 bp。GP氨基酸序列同源性明显高于相应的核苷酸序列(除Mokola外),4株街毒与CTN的同源性高于aG株。GP不同区段比较显示,膜外区同源性高于膜内区。G-M区间核苷酸序列长度为5 bp;除广西4外,其余毒株100%同源。GL区间核苷酸序列长度为2,4 bp,越1与肥东同源性为100%。结论4株RV均属于基因I型。广西的毒株之间存在不同的来源。街毒与疫苗株之间基因存在差异。4株RV与SAD-B19进化途径相近,与PV株相差较远。越1与肥东株亲缘关系极近,可能是由同一毒株演化而来。
关键词(KeyWords): 狂犬病毒;糖蛋白(GP);基因序列;G-L区间;G-M区间
基金项目(Foundation):
作者(Author): 刘胜牙,严家新,徐葛林,吴杰,郑新雄
DOI: 10.13200/j.cjb.2004.03.5.liushy.001
参考文献(References):
- [1] 杨占秋.临床病毒学.北京:中国医药科技出版社,2000.
- [2] Tordo N.Onderetepoort.J Vet Res, 1993,60:315-323.
- [3] 严家新.狂犬病流行简史.中华医史杂志,1994,24(4) :196-199.
- [4] 严家新.狂犬病毒分子流行病学研究进展.国外医学病毒学分册,1995,2(2) :34-37.
- [5] 徐葛林,Li Ku,吴杰,等.中国19个狂犬病病毒街毒分离株N基因的序列分析.病毒学报,2002,18(1) :48-51.
- [6] Kissi B, Tordo N, Bourhy H. Genetic polymorphism in the rabies virus nucleoproetin gene. Virology, 1995,209:526-537.
- [7] Benmansour A,Brahimi M,Tuffereau C,et al. Rapid sequence evolution of street rabies glycoprotein is related to the highly heterogenous nature of the viral population. Virology, 1992,187:33-45.
- [8] Sacramento D, Badrane H, Boury H, et al. Molecular epidemiology of rabies virus in France: comparison with vaccine strains. J Gen Virol, 1992, 73:1149-1159.
- [9] Bourhy H, Kiss B ,Tordo N. Molecular diversity of the lyssavius Genus. Virology, 1993,193:1-12.
- [10] Arai YT.Yamada K,Kameoka Y,et al.Nucleoprotein gene analysis of fixed and street rabies virus variants using RT-PCR. Arch Virol, 1997, 142:1787-1796.