肾综合征出血热灭活疫苗毒株84Fli株的M和S基因核苷酸序列分析Nucleotide Sequencing of M and S Genes of Hantavirus 84FLi Strain for Production of Inactivated Haemorrhagic Fever with Renal Syndrome Vaccine
李静;孔艳;董关木;安祺;杨立宏;周荔葆;俞永新;
摘要(Abstract):
目的对肾综合征出血热灭活疫苗毒株84Fli株的M和S基因进行核苷酸序列分析,了解该毒种的基因稳定性。方法根据汉坦病毒标准株设计特异的PCR引物,用RT-PCR技术分段扩增疫苗株84FLi株的M和S基因片段,PCR产物纯化后直接测序,并进行遗传进化分析。结果疫苗株84FLi株M基因片段的核苷酸序列与GenBank中收录的HTN型毒株的M基因核苷酸序列的同源性为83.5%~99.9%,而与SEO型毒株的同源性为70.2%~72.0%。其S基因与HTN型毒株的同源性为85.9%~99.6%,与SEO型毒株的同源性为69.4%~70.8%。疫苗株84FLi株的M和S基因的氨基酸序列与GenBank中收录的HTN型汉坦病毒84FLi株M和S基因的氨基酸序列的同源性分别为99.9%和99.5%。从遗传进化树上可以看出,疫苗株84FLi株与GenBank中收录的84FLi株位于一个独立的分支上,与其他HTN型病毒亚型分布于不同分支上,与其他HTN型病毒亚型亲缘关系较远。结论肾综合征出血热灭活疫苗毒株84FLi株M和S基因片段的核苷酸和氨基酸序列未发生较大变异,说明在传代过程中该疫苗株在基因水平上并未发生较大改变。
关键词(KeyWords): 汉坦病毒;M基因;S基因;核苷酸序列
基金项目(Foundation):
作者(Authors): 李静;孔艳;董关木;安祺;杨立宏;周荔葆;俞永新;
DOI: 10.13200/j.cjb.2009.08.41.lij.024
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