中国生物制品学杂志

2021, v.34(07) 804-810

[打印本页] [关闭]
本期目录(Current Issue) | 过刊浏览(Past Issue) | 高级检索(Advanced Search)

牛miR-504靶基因对奶牛乳房炎调控机制的预测分析
Prediction and analysis of mechanism of bta-miR-504 target gene in regulating mammitis in dairy cows

潘翠丽;汪书哲;王兴平;罗仍卓么;魏大为;蔡小艳;马云;

摘要(Abstract):

目的预测分析牛miR-504(bta-miR-504)靶基因对奶牛乳房炎的调控机制。方法应用miRBASE数据库检索并分析miR-504成熟序列在不同物种中的保守性,TargetScan及miRWalk软件预测bta-miR-504的靶基因,DAVID在线软件对靶基因进行GO分类统计注释分析和KEGG通路注释分析,STRING在线软件和Cytoscape软件进行蛋白相互作用分析,采用Cytohubba软件中的11种方法计算并分析候选靶基因中的核心基因。结果 miR-504成熟区序列在不同物种间呈高度保守。共筛选出477个bta-miR-504候选靶基因,其参与的主要生物过程包括细胞内信号转导、细胞内蛋白转运和负调控MAPK活性等,显著富集于癌症、内吞、Ras、雌激素和胰岛素信号通路。与候选靶基因编码蛋白存在较多互作关系的蛋白包括TOLLIP、RIK3R1、TRAF6、EGFR、FBXL20、FBXL18、FBXO41、FBXL12等,其编码基因参与癌症、催乳激素、雌性激素、胰岛素、NF-kappa B、AMPK、Ras、TNF及心肌细胞肾上腺激素等信号通路。btamiR-504候选靶基因调控网络中的核心基因为TRAF6和CFTR。结论 bta-miR-504核心候选靶基因TRAF6和CFTR可能通过AMPK、Ras、Hepatitis C和Measles信号通路参与奶牛乳房炎的调控作用。

关键词(KeyWords): miR-504;靶基因预测;乳房炎;信号通路;调控网络

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家现代农业(奶牛)产业技术体系建设项目(CARS-36);; 宁夏回族自治区重点研发计划项目(0400/021904000110);; 宁夏优势特色牛产业科技创新团队(03010360052);; 宁夏大学高层次人才启动经费(030900001926)

作者(Author): 潘翠丽;汪书哲;王兴平;罗仍卓么;魏大为;蔡小艳;马云;

Email:

DOI: 10.13200/j.cnki.cjb.003374

参考文献(References):

扩展功能
本文信息
服务与反馈
本文关键词相关文章
本文作者相关文章
中国知网
分享